Milieucentrum Utrecht werkt in projecten en activiteiten samen met:
- Gemeente Utrecht
- Provincie Utrecht
- Utrecht Natuurlijk
- Natuur-en Milieufederatie Utrecht
- Energie U
- Groen Moet Je Doen
- De Jonge Klimaatbeweging
- Wijkwijzer Noordoost
- Kerngroep Ring Utrecht
- Hoogheemraadschap De Stichtse Rijnlanden
- Samen030
- Wijkcooperatie Kanaleneiland
- De Kargadoor
- Hogeschool Utrecht
- Universiteit Utrecht
- Institute for Risk Assessment Sciences (IRAS)
- Duurzame Week
- De Waag
- Groenwachtersgilde
- Bibliotheek Utrecht
- Makerscommunity HaHaHo
- BuurtBel Wittevrouwen
- Utrecht in Dialoog
Andere milieucentra in Nederland
Milieucentrum Amsterdam (de Gezonde Stad)
Milieucentrum Den Haag (Duurzaam Den Haag)
Rotterdams Milieucentrum
Milieucentrum Nijmegen